I'm busy in a research report this week, a lot of programming work is needed. Here is the requirement: creage a data set follows exponetial distribution with a mean value mu, using this data set as parameters to run some existed progrmming in java.

I found a GNU libraray called GSL to create this data set. Wow, it's another story about how to deploy it, however, most problems can be solved by the mannual, url: http://www.gnu.org/software/gsl/ Here is the introduction from this website:

The (GSL) library provides a wide range of mathematical routines such as random number generators, special functions and least-squares fitting. There are over 1000 functions in total with an extensive test suite.  Hope this may be helpful for those guys who have similar mathematical requirment.

My problem is, since the library is c/c++ based, I have to write a c/c++ program to use it. However, it will be tedious to change my existing java code into c. So finally I have to face and solve the problem of calling a c progrm in java, Java Native Interface-JNI, which I'm afraid of touching before. Here I list the steps:

1. write a java program ("Node.java" for my example) that will call the c program, includes this code segements:

static
{
System.loadLibrary("randGen");
}
public native static double getData(double m);

here, getData(int m) is the method that you have to implement in c, don't implent it in this java file! randGen is the "randGen.so" file  I would like to create from the corresponding c file.

2. compile the "Node.java" file as usual: javac Node.java, then you'll get Node.class file.

3. "javah Node" to create a "Node.h" file, "-gni" is a default option for this command, so you don't have to "javah -gni Node"

4. Now, take a look at "Node.h", it's like this:

/* DO NOT EDIT THIS FILE - it is machine generated */
#include <jni.h>
/* Header for class Node */

#ifndef _Included_Node
#define _Included_Node
#ifdef __cplusplus
extern "C" {
#endif
/*
* Class: Node
* Method: getData
* Signature: (D)D
*/
JNIEXPORT jdouble JNICALL Java_Node_getData
(JNIEnv *, jclass, jdouble);

#ifdef __cplusplus
}
#endif
#endif

you see setence: JNIEXPORT jdouble JNICALL Java_Node_getData (JNIEnv *, jclass, jdouble); that's what we should implent in our c code!

5. Move to c code, here is my exmple "randGen.c":

#include <stdio.h>
#include <gsl/gsl_rng.h>
#include <gsl/gsl_randist.h>
#include "Node.h"
const gsl_rng *gBaseRand;
JNIEXPORT jdouble JNICALL Java_Node_getData(JNIEnv * a, jclass b, jdouble mu)
{
unsigned long randSeed;
double k;
/* specifying to use Mersenne twister MT-19937 as the uniform PRNG */
gBaseRand = gsl_rng_alloc(gsl_rng_default);
srand(time(NULL)); /* initialization for rand() */
randSeed = rand(); /* returns a non-negative integer */
gsl_rng_set (gBaseRand,3); /* seed the PRNG */
k = gsl_ran_exponential(gBaseRand, mu);
gsl_rng_free(gBaseRand);
return k;
}

I highlight the related jni setences in red: first, include the .h file; further, implent the function defined in the .h file, add some parameters to this function, remain other parts unchanged! Notice that i have some setences regarding GSL here.

6. gcc -shared -o randGen.so -lgsl -lgslcblas -lm

words unline are required by GSL. -shared is a must option to get a ".so" file. Also, notice that here the "randGen" of "randGen.so" correspondes to System.loadLibrary("randGen"); in the java file.

7. quite imporant and easy to ignore: add the location where you'd like to place the ".so" file in the environment variable "LD_LIBRARY_PATH", as for me, I include current directory: export LD_LIBRARY_PATH = $LD_LIBRARY_PATH:.

source .bash_profile 

8. now, ready? run your java file! java Node, etc. for me.

This is an exciting experience, I also wanna it unforgettable, that's why I blogged it here.

enjoy it~. 

Thanks to Cong~

发信人: cadaver (饭团), 信区: Feeling
标  题: [zz]广埠屯街道口珞珈山
发信站: BBS 珞珈山水站 (Sat Dec  9 01:07:29 2006)
 10年前的广埠屯街道口珞珈山没有现在这般繁华，楼房没有这样高，那时还没有群光，没
有新世界。那是劝业场很繁华，水货日用品和食品，拥挤在一条街上。那时候秦朝欧帕娜
，滚轴人头攒动。那时候没有网吧，也没有一夜情。
    那时候同居是违法的，是要被学校开除的，那时避孕套是不能四处购买的。
    那个时候我和现在一样年轻，走在这一线，在无数盗版光盘，劣质图书，廉价录象，
在一片同学A片要么毛片好看，办证不？招募男女公关的市声里起伏，在知识就是力量，科
技就是生产力，万般皆下品唯有读书高的叫嚣下面壁图破。
    那个时候我在湖北省歌舞剧团门口看PL的女演员，回去后好做一个关于现在和未来的
梦，那个时候519路车带我去汉口，在江汉路、中山大道消磨一个周末的时光。
   我的同学们把爱情和青春挥洒在这里，1996年，我战立在这里，听见一个东北人为了爱
情来看她女朋友，在樱园楼上照相，往后退时，摔死的消息。东北人的血液和12。9运动先
烈的热血一起浇灌在樱花灿烂的土地上。我的校友彭说，樱花是国家耻辱。他现在编一份
四平八稳的报纸，言辞平缓，唯一发表的言辞激烈的文字是我半年前写的一篇言论稿，里
面是隐射和嘲讽，他当然知道，但还是发了。我先前还没注意到他编这版，因为我从不看
这报。我只投稿。
    1996年，有一个杀人狂在广埠屯街道口珞珈山一线高校疯狂猎杀长发白裙MM，为此我
长发白裙的大学女友有了夜晚和我一起的理由，为此在那个恐怖谣言和杀人空气弥漫的季
节，爱情反而旺盛成长，这些爱情元素和多年前***人刺刀下鲜艳夺目的樱花一起成为风景
，注定飘逝在以前以前。
   1996年，有一个毕业10年的校友把自己吊死在他们初恋女友定情的后山的树上。我和她
唏嘘了很久，我们的眼睛湿润，我们的心灵震撼。10年后，我不记得我是否有过初恋，怀
疑自己是否真正的恋过爱过？它到底发生在哪一年，在哪里？
    从前座机还不发达，手机极其罕见，BP机也未流行。从前的约会使用口头传递消息，
从前我们不知道对方在哪里，在干什么。思念无处不在，想念如水荡漾。
    从前我们把爱写进情诗情书，写在纸上。从前的爱情很慢很慢。慢的仿佛没有开始，
也永远不会结束。
    从前没有网吧没有酒吧，我们在舞厅里跳舞，在图书馆、教室自习，寻找PLMM。从前
没有各种聚会没有各种活动，新生来了，热情的老乡携手相送，PL女老乡的行李被无数男
人宽厚的手掌传递。
    从前没有BBS，没有internet,偶们各种社团处拉美女入伙，然后分割蚕食。
    从前我和现在一样单纯，一样没有钱，在学校女生宿舍等自己的MM出现，和她一起走
在学校的路上，走在黑暗的地方，心理却亮堂堂的。从前我和现在一样胆怯，一样高傲，
不敢去牵MM的手，不敢表达。害怕拒绝，对别人的爽约，懊恼和沮丧。在学校机房用1。4
4寸磁盘从游戏厅在486机器上，DOS下下COPY无数游戏消磨时间。
   从前我们说老地方老时间见，现在时间和地点都变了。
   从前我们说永远有多远，永远在分手的时间结束。
   从前我们不谈物质不说将来渴望远行向往外边的世界，却忘记了终于有一天心还会回到
从前，人还会来到旧日场景。
    从前我们高唱爱情，讴歌专一和执着，从前我们有太多时间去爱，太多青春可以徘徊
，足够慢慢让爱远去离开。今天我们都已经改变，不敢轻易奢侈爱情，没有时间热情和冷
却，没有精力去记得和忘怀。
    从前的花儿和现在一样鲜艳，从前的叶子和现在一样的金黄。从前的旅社要结婚证住
宿，派出所要查房。现在身份证都不带的学生牵手走进旅社，公开完成生命中必须隐秘的
情节。
      从前的青春压抑在书本和就业、考试里，今天的青春放纵在QQ、短信、床上。
        从前研究生很NB，本科生很抢手，专科生很SB，中专生很土B。
       今天初中生是老板，中专生是领导，专科生是科员，本科生在干技工，硕士生在找
工作。。。。。。。
从前我在学校泡本科PLMM，今天我在学校泡硕士PLMM。
       从前我在等自己慢慢变老，现在却发现自己越来越小。
        从前我希望早点成熟复杂，现在却刻意简单幼稚。
       从前别人叫我同学、朋友，今天别人叫我师傅、先生。
        从前的广埠屯街道口珞珈山和今天一样在武昌的某处，我和从前一样在等待，只
是无是无非，对于结果和未来不做期待。对于过程和感触不做评价，我只是在等待，等待
一个人，从街的那一边走过来，我可以认出她的样子，我终于可以慢慢地说出一句话：“
你来了，10年前我就在此处。现在我还在。”